据考古学发现，早在旧石器时代，瓦维尔山就已有人居住。大约追溯到公元7世纪，克拉科山岗和婉达山岗居住着定居者们的首领，Vistulans的斯拉夫族人。克拉科夫在科尔多瓦商人Ibrahim-Ibn-Jacob写于985年的一份报告里第一次被提及。他描述了一座位于森林环抱的商路十字口的富有城市。在皮雅斯特王朝到来之前，这座城市有两个历史上著名的时期。876年到879年之间，大摩拉维亚诸侯斯瓦托普卢克占领了后来被称作“小波兰”的地区。 955年之后，统治捷克的波列斯拉夫（Boleslav Okrutny）诸侯，即圣瓦茨拉夫的弟弟，在这里推行捷克法律。10世纪时克拉科夫被并入波兰。但还不能肯定到底是在梅什科一世在位间的990年，还是波列斯瓦夫一世（勇敢者）/Boleslaw I Chrobry在位期间的999年。
中世纪中世纪瓦维尔山已有卫城和戍边居民，并以土木工事来保护这些居民。10世纪和11世纪建造了最初的砖建筑，即城堡和几座罗马式教堂，包括：大教堂，长方形圣费利克斯和圣Adauct教堂(Feliksa i Adaukta)。1000年在克拉科夫第一次设立主教管区。1150年，在城堡教堂建立了一座天主教学校，在克拉科夫大学建立之前，它曾是波兰最好的学院。大教堂的宝库里保存着皇家标志：国王波列斯瓦夫二世（英勇的）/Boleslaw II Smialy的王冠和权杖。保存了28本书籍的图书馆馆藏丰富，其中除了宗教文学以外还保存了几本古典文学书籍，如泰伦斯的喜剧、奥维德的挽歌、索尔斯蒂尤斯历史专论等。 1142年Robert主教对用来取代原来被毁的罗马式教堂的“第二座”瓦维尔教堂进行神化。将圣斯坦尼斯洛斯的尸体和圣徒遗物从Skalka的教堂移至此处，正式地安放在这座新建的宏伟堂皇的大教堂里。 12世纪波兰的封建割据和小诸侯之间的连年争战，并没有阻碍克拉科夫的快速发展。1138年，由于根据国王波列斯瓦夫三世（歪嘴）/Boleslaw III Krzywousty 的遗嘱，克拉科夫城堡将继续作为高级政治中心并扮演波兰首府的角色，其地位也随之变得更加重要。1241年鞑靼人侵略之后，原来被毁的罗马式建筑被新的哥特式建筑所取代。1257年参照马格德堡法律，在克拉科夫进行新的城市设计规划，包括中央广场和方格式道路网。13世纪建造新的防御工事系统，包括防御墙体，射击塔以及加固大门，随后的世纪中全部防御体系经历了逐渐地改造和改善。1320年1月2日于克拉科夫进行第一次加冕礼，即瓦迪斯瓦夫一世（矮子）/Władysław Łokietek和其妻子海德薇格/Jadwiga的加冕礼。随后5个世纪中进行了35次加冕礼。当时大教堂也成为波兰国王的埋葬地。
卡西米尔三世（大帝）1310-1370
卡西米尔三世在位期对克拉科夫有深刻的影响，他是一位杰出的学者与艺术家赞助人。卡西米尔三世设立了两个和克拉科夫有密切关系的城市，即 Kazimierz市和Kleparz市。当时还建造了圣芳济会和道明会两座哥特式教堂，之后继续建造了圣玛丽亚教堂、Kazimierz市的圣体教堂Bozego Ciala和圣凯瑟琳教堂 sw. Katarzyny ，还重建了瓦维尔山的大教堂和城堡以及Sukiennice纺织会馆的中世纪市场厅和旧市政府楼等公共建筑。雅盖隆大学起源于1364年卡西米尔三世设立的克拉科夫学院。
雅盖洛王朝时期
瓦维尔大教堂里国王卡齐米日四世•雅盖隆契克/Kazimierz IV Jagiellonczyk石棺上Wit Stwosz的雕刻作品。
立陶宛大公瓦迪斯瓦夫二世•亚盖洛于1386年加冕为波兰国王，开始了波兰统治时间最长的王朝（200多年）。克拉科夫成为统一波兰本土、大立陶宛和鲁塞尼亚领域的联邦首府。皇室宫廷在促进文化和艺术活动方面影响颇深，曾经邀请过许多著名的古典主义学者，科学家和艺术家到克拉科夫。1477年克拉科夫商人要请维特•施托斯（Wit Stwosz）从纽伦堡来到该城市，委托他雕刻圣玛丽亚教堂的巨大木制圣坛。经过1499-1536年的改造，瓦维尔山的城堡成为一座杰出文艺复兴式建筑，大教堂里的国王西吉斯蒙德的小教堂（Kaplica Zygmuntowska）成为波兰最漂亮的小教堂墓地。保存着从佛兰德斯订购的优美挂毯的城堡，成为现代伟大国王的辉煌宫殿。
13世纪的大教堂专用图章。图章上有由弗瓦迪斯瓦夫一世Herman出资建造的罗马式大教堂。
14世纪将首都迁移到华沙。克拉科夫失去了其原来的地位，只保留了正式国王的加冕礼和埋葬地权利。
17世纪
17世纪波兰飞翼铁骑的盔甲。1683年国王杨三世•索别斯基驰援维也纳时，其军队就带这种盔甲。
据说17 世纪上半叶，有大批市民死于天花，人数达到2万多人。随后瑞典军队侵略破坏了Kazimierz市、Kleparz市，克拉科夫郊区以及老城。克拉科夫成为地方城市，作为小商业和工艺的中心，天主教教堂是其唯一的艺术赞助。被破坏的教堂和修道院重新建造成巴洛克式风格。当时最大的建筑成就是由Tylman van Gameren设计的圣安娜教堂（sw. Anny），里面有由Baltazar Fontana建造的拉毛粉饰。
18-19世纪
1702年瑞典军队又再一次侵略破坏了克拉科夫。瓦维尔山城堡被烧毁。普鲁士和俄罗斯军队彻底推翻了这座城市。 1772年波兰第一次被瓜分之后，奥地利军队侵略了部分“小波兰”地区。1794年3月24日由柯斯丘什科率领的起义在克拉科夫爆发。最后依据1795年瓜分条约将克拉科夫市移交给奥地利国管辖。被瓜分之后的几百年里克拉科夫的发展可谓一帆风顺。该城市临时并入华沙公国组，拿破仑下台之后得到自由城市身份。推翻原来城墙并建造Planty绿化带，在城墙线之外建造新的郊区。11月起义失败之后，克拉科夫成为唯一保持自治政府的波兰城市。1846年克拉科夫又并入奥地利国。虽然受到外国侵略，但是克拉科夫能够享受较大的自由。此时期克拉科夫成为波兰民族的象征和国家精神的重心。在此时期内也设立并发展了几个文化科学协会，在克拉科夫科学协会基础上形成波兰学识学院（Akademia Umiejetnosci），并于1818设立了美术学院，1854年设立了艺术爱好者协会。
20世纪
即将与俄罗斯展开的战争推动了独立解放运动的发展。1910年设立了“Strzelec“（射手）准军事协会。克拉科夫允许大部分政治党的合法活动。1914年8月6日第一干部连队从克拉科夫Oleandry路出发参加解放活动。 1918年克拉科夫解放之后成为主要的行政和艺术中心。工业发展也很迅速。 第二次世界大战虽没有影响到古老的建筑，但却导致了其他的重大损失。 1939年11月6日该城市最著名的人才，包括雅盖隆大学教授，被运送到Sachsenhausen集中营。 二战结束之后克拉科夫失去了从前的特权地位。当时的统治者旨在限制知识分子的影响。因此决定建造Nowa Huta新工业郊区，随后大量的移民人口来到克拉科夫。但是无论如何，如今学者和艺术家对克拉科夫的影响还是最为深刻的，而他们也成为这座80多万人口城市的最大优势。